公司涉嫌虚开发票会面临多种法律风险，具体如下：
1、刑事责任风险：公司及相关责任人员可能因虚开发票构成犯罪而被追责。例如，某公司法定代表人指使财务人员为其他公司虚开增值税专用发票，且税款数额较大，该公司被认定为单位犯罪，被判处罚金，法定代表人及财务人员作为直接责任人员被判刑。
2、经济损失风险：公司会面临补缴税款、滞纳金和罚款。比如，某公司虚开普通发票金额较大，被税务机关查处后，需补缴税款、缴纳滞纳金，并被处以罚款，导致经济损失，影响正常经营。
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处理公司涉嫌虚开发票问题时，以下特殊情况或例外情形会影响处理结果：
1、主动投案并如实供述：若公司在被查处前主动向税务或司法机关投案，如实供述犯罪事实，依据《中华人民共和国刑法》自首规定，可从轻或减轻处罚，犯罪较轻的甚至可免除处罚。相较于被查处后被动承认，处理结果会更轻。
2、被胁迫参与：若公司相关责任人员受他人胁迫参与虚开发票，且无其他选择，依据《中华人民共和国刑法》胁从犯规定，应按情节减轻或免除处罚，这会影响责任认定和处罚结果。
3、为骗取出口退税虚开：若公司虚开发票是为骗取国家出口退税，属于情节严重情形，处罚会更严厉，罚款金额更高，相关责任人员刑期可能更长。
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公司涉嫌虚开发票时，责任主体需根据具体行为和主观过错确定，具体如下：
若公司独立决策实施虚开发票且为整体利益，公司作为法人需承担法律责任，包括补缴税款、滞纳金、罚款，构成虚开发票罪的还会被判处罚金。
若法定代表人、总经理、财务负责人等直接负责的主管人员，在虚开发票中起决定、批准、授意、纵容、指挥等作用，需承担刑事责任。
若财务人员、开票员等其他直接责任人员，明知是虚开发票仍积极参与，也需承担刑事责任。
若受票方明知或应知公司虚开发票，仍接受用于抵扣税款、报销等，也可能承担补缴税款、罚款等责任，构成犯罪的需负刑事责任。
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公司涉嫌虚开发票的责任认定，《中华人民共和国刑法》有明确法律依据，结合相关法条分析如下：
《中华人民共和国刑法》第二百零五条规定，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，单位犯罪的，对单位判处罚金，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处三年以下有期徒刑或拘役；虚开税款数额较大或情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑；数额巨大或情节特别严重的，处十年以上有期徒刑或无期徒刑。该法第二百零五条之一规定，虚开其他发票且情节严重的，单位犯罪的，对单位判处罚金，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款规定处罚。因此，公司若构成单位犯罪，需被判处罚金，直接负责的主管人员和其他直接责任人员则要根据虚开情节和后果承担相应有期徒刑、拘役等刑事责任。

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